Подумывали о создании военизированного отряда быстрого реагирования, но BSAA был всего лишь общественной организацией. Его сотрудники не имели юрисдикции на проведение инспекций, следствие, аресты и даже на применение силы в критических ситуациях. Однако было очевидно, что с угрозой международного биотерроризма нужно что-то делать, и немедленно. Поэтому BSAA был преобразован в международное агентство под эгидой ООН. В новом статусе службы специального назначения при ООН легитимность BSAA для стран-участников была несомненна. Однако в действительности лишь 70 процентов стран-участниц одобряли деятельность BSAA на своей территории, а остальные допускали ее представителей лишь на разовой основе. Так оформилась нынешняя структура BSAA. Штаб-квартира организации расположена в Англии. Некоторые источники утверждают, что у региональных отделений имеются базы на территории соответствующих регионов. Крис Редфилд относится к североамериканскому отделению, контролирующему весь североамериканский континент, а Шева Аломар — к западноафриканскому отделению.
Каждое отделение BSAA имеет многочисленные тактические подразделения, укомплектованные главным образом выходцами из армии и полиции разных стран. Небоевое подразделение также достаточно велико по размеру и комплектуется главным образом из бывших сотрудников государственных организаций разных стран. Имеется множество экспертных групп для технической, медицинской, физической и ментальной поддержки оперативников.
Оперативные силы BSAA разделены на два типа — оперативная группа (SOU) и оперативные агенты (SOA):
- SOU имеют полномочия находиться на подконтрольной территории, вступать в боевые действия и нейтрализовать нарушителей. Обычно группа состоит из 12 человек и разделена на три ячейки по четыре человека. Отличительной особенностью SOU является гибкость структуры на задании. Для соответствия масштабам задачи обычной практикой является усиление группы ячейками из других групп.
- SOA — оперативные агенты, действуют в одиночку. Они главным образом занимаются разведкой и шпионажем — иными словами, это глаза и уши BSAA. На некоторых операциях применение оперативных групп оказывается проблематичным, поэтому они поручаются агентам. На таком задании стандартной боевой единицей является ячейка из двух человек.
Оперативные агенты — профессионалы высшей пробы и по рангу выше бойцов оперативных групп, но при отборе агентов главным является не физическая подготовка или умение обращаться с оружием, а психологическая устойчивость и навыки кризисного управления. В плане физической и тактической подготовки бойцы опергрупп могут превосходить агентов. Одиннадцать первых участников BSAA пользуются огромным уважением в организации и известны как «Первые одиннадцать» — по аналогии с «Первой семеркой» астронавтов проекта «Меркурий». Одним из Первых одиннадцати является Крис Редфилд, другие, также как и он, работают в тесном сотрудничестве со многими оперативными группами.