Будущих бойцов придется искать прямо на улицах Рима, спасая их от нападок солдат Борджиа. Потенциальные кандидаты отмечены на глобальной карте особыми черными крестами, которые появляются только после уничтожения башен Борджиа. Максимальное количество ассасинов в гильдии — 12. Большинство из них со временем пройдут путь от новобранца до ассасина, что составляет 10 ступеней мастерства. За каждого первого, четвертого и шестого рекрута выдается сигнал вызова ассасинов (красные ячейки под шкалой здоровья). Вызывать ассасинов на помощь можно только тогда, когда они не на заданиях (клавиша [T]). Улучшать, развивать и отправлять ассасинов на задания в ближайшие европейские страны можно из убежища Эцио (подпольная штаб-квартира Братства в Риме, расположенная в центральном районе города), через любую освобожденную башню Борджиа или многочисленные голубятни. В первом случае для взаимодействия нужно обратиться к карте на столе, нажав клавишу [E], во втором — подойти к двери или голубятне и нажать [Shift].
Новые контракты появляются постепенно. За успешное выполнение заданий рекруты получают очки опыта, которые влияют на уровень мастерства, и предметы для торговцев, из которых можно сделать уникальное оружие. На каждом новом уровне рекрутов можно развивать, выбирая улучшение между оружием и доспехами. Выбор улучшений происходит через меню управления ассасинами. Доспехи увеличивают защиту, оружие — атаку. Степень риска и сложность заданий указываются при выборе контракта. На задания можно отправлять сразу нескольких ассасинов, опыт будет поделен между ними поровну. Чем они опытнее, тем выше вероятность успеха. На смену погибшим ассасинам нужно вербовать новых; они не попадают в плен и не травмируются, любая серьезная ошибка — смерть. В случае гибели ассасина на задании или во время защиты Эцио все этапы по обучению и набору опыта придется проходить вновь. Новичок не станет в одночасье мастером. Если малоопытные ассасины вызываются прямо в бой, нужно внимательно следить за их уровнем здоровья, а в критические моменты помогать отбиваться от врагов, иначе они будут убиты.