Улучшения оружия покупаются за кредиты и поделены на 10 уровней (при первом прохождении игры, без импорта персонажа из Mass Effect 3, доступно только 5 уровней), они также как и модификации влияют на характеристики оружия, снижая вес, увеличивая наносимый урон и боезапас. Улучшенное оружие позволяет устанавливать более мощные модификации. Большое количество разнообразных модификаций для оружия можно найти при выполнении заданий, оставшаяся часть продается в магазинах Цитадели. Ассортимент товаров у торговцев постепенно меняется и расширяется. Гранаты и тяжёлое оружие модифицировать нельзя.
Модификации оружия из заданий в Mass Effect 3:
- Марс
- Пистолет-пулемет: прицел
- Пистолет-пулемет: сверхлегкие материалы
- Дробовик: ствол крупного калибра
- Дробовик: разрывная модификация
- Снайперская винтовка: длинный ствол
- Снайперская винтовка: модуль концентрации
- Лаборатория «Цербера»
- Снайперская винтовка: улучшенный прицел
- Менае, спутник Палавена
- Пистолет: бронейбойная модификация
- Пистолет: улучшение магазина
- Штурмовая винтовка: бронебойная модификация
- Штурмовая винтовка: улучшение магазина
- Снайперская винтовка: боезапас
- Снайперская винтовка: улучшенный прицел
- Академия Гриссома
- Пистолет-пулемет: радиатор
- Пистолет-пулемет: улучшение магазина
- Штурмовая винтовка: стабилизатор
- Штурмовая винтовка: точный прицел
- Снайперская винтовка: бронебойная модификация (если спасен Дэвид Арчер из дополнения Overlord)
- Сур'Кеш
- Пистолет: ствол крупного калибра
- Пистолет: прицел
- Дробовик: съемный штык
- Дробовик: боезапас
- Штурмовая винтовка: длинный ствол
- Утукку
- Пистолет: ствол крупного калибра
- Пистолет: бронебойная модификация
- Пистолет-пулемет: ствол крупного калибра
- Дробовик: разрывная модификация
- Дробовик: боезапас
- Тучанка: турианский взвод
- Пистолет-пулемет: улучшение магазина
- Пистолет-пулемет: сверхлегкие материалы
- Дробовик: адаптивный глушитель
- Снайперская винтовка: боезапас
- Снайперская винтовка: длинный ствол
- Тучанка: бомба
- Пистолет: ручной парадизатор
- Пистолет: прицел
- Пистолет-пулемет: радиатор
- Дробовик: съемный штык
- Снайперская винтовка: модуль концентрации
- Тучанка: генофаг
- Пистолет: ручной парадизатор
- Пистолет: улучшение магазина
- Пистолет-пулемет: прицел
- Дробовик: адаптивный глушитель
- Штурмовая винтовка: длинный ствол
- База истребителей «Цербера»
- Пистолет: улучшение магазина
- Захваченная Цитадель
- Пистолет: бронебойная модификация
- Пистолет: ствол крупного калибра
- Штурмовая винтовка: бронебойная модификация
- Снайперская винтовка: длинный ствол
- Снайперская винтовка: бронебойная модификация
- Гелликс, спасение бывших ученых «Цербера»
- Пистолет-пулемет: ствол крупного калибра
- Дробовик: боезапас
- Штурмовая винтовка: улучшение магазина
- Снайперская винтовка: бронебойная модификация
- Лесусс, монастырь ардат-якши
- Пистолет: ручной парализатор
- Штурмовая винтовка: точный прицел
- Штурмовая винтовка: стабилизатор
- Снайперская винтовка: боезапас
- Дредноут гетов
- Пистолет-пулемет: прицел
- Дробовик: адаптивный глушитель
- Штурмовая винтовка: точный прицел
- Снайперская винтовка: улучшенный прицел
- Раннох, спасение адмирала Заал'Кориса
- Пистолет-пулемет: улучшение магазина
- Дробовик: разрывная модификация
- Штурмовая винтовка: улучшение магазина
- Раннох, база Жнецов
- Пистолет-пулемет: ствол крупного калибра
- Пистолет-пулемет: сверхлегкие материалы
- Штурмовая винтовка: бронебойная модификация
- Штурмовая винтовка: стабилизатор
- Тессия
- Пистолет-пулемет: радиатор
- Штурмовая винтовка: длинный ствол
- Снайперская винтовка: модуль концентрации
- Горизонт, Святилище
- Пистолет: прицел
- Дробовик: съемный штык
