Улучшать экологический баланс предстоит с помощью станций по управлению погодой, доступной в строительном меню, на закладке «Эко-служащие». Размещаем станции по всей площади острова, стараясь не пересекать зоны влияния, иначе производительность сильно снизится. Расширяем территорию новыми хранилищами, а запасы энергии пополняем ветропарками. Прибыль поселения сократится, с развитием она восстановится, пока же торгуем чаем, инструментами и прочими товарами с ковчегом Яны Родригес. Разобравшись с экологией на первом главном острове, переходим ко второму.
Однако сначала надо развить поселение до уровня эко-инженеров, так как одних только станций по управлению погодой на этот раз не хватит. В награду за очистку первого острова Яна Родригес выдаст семена овощей, активируем их в предметной ячейке склада. Теперь налаживаем производство полезной еды, построив на главном острове овощную ферму и завод натуральной пищи. На соседнем, загрязненном острове, строим склад и рисовые фермы, свозим рис на главный остров, где получаем в итоге полезную еду. Передаем одну тонну овощей Яне Родригес. Осталось наладить поставки коммуникаторов.
Увеличиваем численность населения до 750 эко-служащих (50 домов). Налаживаем добычу песка, строим карьер на реке, устанавливаем медную шахту на склоне горы, достраиваем фабрику микрочипов и завод электроники, который займется выпуском коммуникаторов. В самом конце, перед переходом на новый уровень, возводим среди жилых домов информационный центр. Разрешаем населению переход на новый уровень цивилизации. Развиваем поселение до 1200 эко-инженеров (48 домов), расширяя при этом производства для удовлетворения их потребностей. Когда появится доступ к станциям мониторинга, строим их на втором загрязненном острове на месте шахт. Экологический баланс придет в норму.